Lammps计算材料的声子Phonon

fix ID group-ID phonon N Noutput Nwait map_file prefix keyword values
## 比如 每10step测量一组格林函数,测了每5000组后输出一次动力学矩阵,
## 等待50w个步长后开始测量
fix 1 all phonon 10 5000 500000 GAMMA EAM0D nasr 100
  • N -> 每隔这么多时间步长测量一次格林函数
  • Noutput -> 每测量这么多次后输出一次动力学矩阵
  • Mwait -> 等待这么多个时间步长后开始测量
  • map_file -> file or GAMMA

lammps的安装文件夹下面有examples,在PACKAGES/phonon里。整个MD计算需要这4个文件:

  • in.EAM3D -> lammps 输入脚本
  • data.pos -> 结构文件,一般是超胞结构
  • map.in -> 超胞中原子的序号对应情况
  • cuu3.eam -> Cu的力场文件(eam/opt力场)

最后得到的结果

MD为lammps分子动力学得到的结果,LD是晶格动力学计算结果,expr为已有的实验数据